Тестовое задание
До того, как технологии на основе системы CRISPR-Cas стали главенствующими подходами по направленному редактированию геномов, для данных целей активно применяли белки, содержащие так называемые «цинковые пальцы» (Zf). Данные белки содержат особые петли, аминокислотные остатки которых (пронумерованы от -1 до 6) узнают азотистые основания в составе молекулы ДНК (пронумерованы от 1 до 4). Научные коллективы по всему миру разработали множество искусственных систем на основе таких белков. В рамках одной из них авторам удалось добиться невырожденного кодирования. Это значит, что каждая из аминокислот на рисунке (обозначены однобуквенным кодом) узнает лишь одно из азотистых оснований. Синим цветом мы обозначили те регионы ДНК, которые вовлечены в обсуждаемые взаимодействия (при каждом акте узнавания все «синие» участки должны контактировать с партнерами). Существует два неочевидных исключения, которые мы упомянем напрямую: G во втором положении ДНК может быть распознан гистидином (H) и G в 4 положении ДНК может быть распознан серином (S). Обратите внимание, что при распознавании длинных участков ДНК зоны, взаимодействующие с разными Zf, перекрываются. Последовательности Zf записываются в порядке -1, 2, 3 и 6. Считайте, что для эффективного распознавания участка ДНК все аминокислотные остатки Zf-доменов должны провзаимодействовать с ДНК.
Обратите внимание, что нумерация Zf-доменов на рисунке совпадает с нумерацией Zf- доменов в вариантах ответа. Внимательно рассмотрите рисунок, после чего укажите верные утверждения:
